Указом Президента Азербайджанской Республики № 512 от 29 декабря 2006 года была создана Государственная администрация гражданской авиации Азербайджанской Республики.  

А указом Президента Азербайджанской Республики от 12 января 2018 года «О некоторых мерах по усовершенствованию управления в сфере транспорта, связи и высоких технологий в Азербайджанской Республике» Администрация была включена в структуру Министерства транспорта, связи и высоких технологий Азербайджанской Республики как Государственное агентство гражданской авиации при Министерстве.

Агентство является центральным органом исполнительной власти, осуществляющим контроль, государственную политику и регулирование в сфере гражданской авиации.

Направления деятельности:

• принимает участие в формировании государственной политики в сфере гражданской авиации и обеспечивает осуществление данной политики;

• осуществляет контроль над безопасностью полетов гражданских воздушных судов, авиационной безопасностью и обеспечением охраны окружающей среды;

• в пределах своих полномочий осуществляет нормативное регулирование;

• осуществляет государственный контроль в сфере гражданской авиации;

• сотрудничает с международными организациями гражданской авиации, принимает участие в их работе, а также взаимодействует с авиационными администрациями зарубежных стран;

• осуществляет единую государственную политику по обеспечению пригодности гражданских воздушных судов к полетам;

• осуществляет в соответствии с национальными и международными требованиями обязательную сертификацию всех субъектов гражданской авиации Азербайджанской Республики, включая авиационную технику и оборудование;

• участвует в разработке правил, регулирующих использование воздушного пространства, правил полета гражданских воздушных судов в воздушном пространстве Азербайджанской Республики и иных нормативно-правовых актов;

• предоставляет разрешение воздушным судам иностранных государств на полеты в аэропорты гражданской авиации Азербайджанской Республики (на регулярной и нерегулярной основе);

• осуществляет инспекционные проверки деятельности субъектов гражданской авиации Азербайджанской Республики;

• формирует на конкурентной основе рынок авиаперевозок;

• принимает участие в расследовании авиационных происшествий (катастроф), произошедших с гражданскими воздушными судами;

• дает заключение по проектам законодательных актов в сфере гражданской авиации.